Có 2 sự phân chia chính trong phân loại: Thú có túi Châu Mỹ và Thú có túi Châu Úc, được thể hiện bằng siêu bộ Ameridelphia (thuộc châu Mỹ) và siêu bộ Australidelphia (thuộc Australia)

• Siêu Bộ Ameridelphia
  • Bộ Didelphimorphia (93 loài)
    • Họ Didelphidae: opossums
  • Bộ Paucituberculata (6 loài)
    • Họ Caenolestidae: shrew opossums
• Siêu Bộ Australidelphia
  • Bộ †Yalkaparidontia
  • Bộ Microbiotheria (1 loài)
    • Họ Microbiotheriidae: Monito del Monte
  • Bộ Dasyuromorphia (71 loài)
    • Họ †Thylacinidae: Thylacine
    • Họ Dasyuridae: antechinuses, quolls, dunnarts, Tasmanian Devil, and relatives
    • Họ Myrmecobiidae: Numbat
  • Bộ Peramelemorphia (24 loài)
    • Họ Thylacomyidae: bilbies
    • Họ †Chaeropodidae: Pig-footed Bandicoot
    • Họ Peramelidae: bandicoots and allies
  • Bộ Notoryctemorphia (2 loài)
    • Họ Notoryctidae: marsupial moles
  • Bộ Diprotodontia (137 loài)
    • Họ Phascolarctidae: Koala
    • Họ Vombatidae: wombats
    • Họ †Diprotodontidae: diprotodon
    • Họ Phalangeridae: brushtail possums and cuscuses
    • Họ Burramyidae: pygmy possums
    • Họ Tarsipedidae: Honey Possum
    • Họ Petauridae: Striped Possum, Leadbeater's Possum, Yellow-bellied Glider, Sugar Glider, Mahogany Glider, Squirrel Glider
    • Họ Pseudocheiridae: ringtailed possums and relatives
    • Họ Potoridae: potoroos, rat kangaroos, bettongs
    • Họ Acrobatidae: Feathertail Glider và Feather-tailed Possum
    • Họ Hypsiprymnodontidae: Musky Rat-kangaroo
    • Họ Macropodidae: kangaroos, wallabies, and relatives
    • Họ †Thylacoleonidae: marsupial lions
  • Bộ †Sparassodonta

†: Tuyệt chủng